シムについては取りあえずこのままでも良さそうに見えます。　4弦側のシムが木部より上に出ていて目立つのでポケットの中に収まっていても良いようには思います。

3弦のペグがかたいことについてです。　4弦のペグはペグブッシュとの間に隙間が見えますが・・・

3弦はナット側に押しつけられています。

反対側に余裕があるので取り付けを微調整しても良いかもしれません。

ネジ穴のいくつかがナット側にズレているので3弦だけ取り付けをし直しても良いかもしれません。

分解してみました。　一番分解した状態でも他のペグより少しだけかたいです。

ギアを取り付けると1周ごとに1カ所、負荷が大きいところがありますが、ネジを緩めて付け直すとかたいところが移動します。　これは直しようがないです。

ヘッドに取り付けたときによりいっそう重く感じるので、ネジ穴を埋めてあけなおして良ければ最大で0.5mmくらいの幅で動かしたいです。